Казахский медицинский университет непрерывного образования берет свое начало с августа 1963 года, когда Советом Министров СССР было принято решение о создании Алма-Атинского государственного института усовершенствования врачей (АГИУВ). В мае 2014 года Постановлением Правительства Республики Казахстан институт был реорганизован и переименован в Казахский медицинский университет непрерывного образования.

Уже на протяжении более чем полвека КазМУНО является координирующим центром в Республике Казахстан по последипломной подготовке высококвалифицированных специалистов и непрерывного профессионального развития медицинских кадров для практического здравоохранения, медицинской науки и образования.

Гордостью университета является преподавательский состав, собранный из высококвалифицированных специалистов. В их числе лауреаты Государственной премии, заслуженные деятели науки РК,  заслуженные врачи РК, члены академии наук РК и зарубежных стран, главные внештатные специалисты Министерства здравоохранения. Более 200 преподавателей имеют различные ученые степени, из них 65 докторов наук, 132 кандидатов наук, 55 сотрудников имеют академическую степень магистра. Профессорско-преподавательским составом осуществляется лечебная и консультативная клиническая деятельность, проводятся консультации самых тяжелых больных по  всей стране.

В КазМУНО насчитывается более 50 кафедр и курсов, где охватывается весь цикл образования: бакалавриат и интернатура, резидентура, магистратура, докторантура и дополнительное образование. Ежегодно здесь принимают около 1500 обучающихся, свыше 10 000 специалистов проходят повышение квалификации из всех регионов.

В 2018 году университет открыл двери для бакалавриата и интернатуры.  Студенты получают образование по 5 специальностям бакалариата: «Общая медицина»,  «Стоматология», «Общественное здравоохранение», «Сестринское дело», «Фармация»,  студенты интернатуры - по двум специальностям: «Общая медицина» и «Стоматология»». Общая медицина интернатуры включает в себя: «Акушерство и гинекология», «Хирургические болезни», «Внутренние болезни», «Общая врачебная практика», «Педиатрия»  В магистратуре и докторантуре образовательные программы реализуются по 4 специальностям: «Медицина», «Общественное здравоохранение», «Медико-профилактическое дело», «Сестринское дело», в резидентуре по 29 специальностям. Повышение квалификации и переподготовка кадров организации здравоохранения осуществляется по 65 специальностям.

С 2017 года университет реализует совместную двухдипломную казахстанско-финскую магистратуру по специальности «Сестринское дело» с двухгодичным сроком обучения.  В рамках академической мобильности магистранты  КазМУНО проходят обучение в университетах прикладных наук JAMK, HAMK и LAHT в Финляндии.

Разработаны и внедрены программы интегрированных циклов обучения  с вовлечением высокоспециализированных казахстанских и зарубежных специалистов, открываются современные лаборатории по неотложным состояниям.

КазМУНО  является первым медицинским университетом в Казахстане, где внедрена инновационная модель медицинского образования и повышения качества медицинских услуг путем телементорства - проект ECHO. Данный проект реализуется в более 15 странах мира. Для реализации данного Проекта при КазМУНО создан Учебный Центр клинического наставничества и повышения квалификации медицинского персонала посредством теле-коммуникационных технологий.

Деятельность Университета в области международного сотрудничества является одним из важным направлением в  развитии университета.  КазМУНО поддерживает деловые отношения с 40 университетами и научными центрами из 20 стран мира.

Для обеспечения непосредственной связи образовательного процесса с практической деятельностью определены 107 клинических баз университета с современным высокотехнологическим оборудованием, включая собственную стоматологическую клинику. Все они находятся на площадках самых крупных медицинских организаций города Алматы, республиканских Научных Центров и институтов разного уровня.

Для повышения качества практической подготовки медицинских специалистов на базе КазМУНО создан Центр практических навыков, где проводится совершенствование обучения клиническим навыкам с применением симуляционного обучения на высокотехнологических современных тренажерах, манекенах и виртуальных  симуляторах. Для иностранных иногородних студентов Вуз располагает шестиэтажным общежитием на более чем 700 мест, библиотекой на 68 посадочных мест, где насчитывается свыше 60 000 экземпляров книг. Здесь читатели могут воспользоваться не только казахстанскими, но и международными информационными ресурсами. К услугам также предоставлен электронный каталог библиотеки, где собраны самые востребованные книги учебной и научной литературы:   уникальные собрания диссертаций, современные полнотекстовые материалы по актуальным проблемам в различных областях медицины.

В вузе активно осуществляется внедрение информационных технологий в образовательный процесс.  Для  инновационных методов организации учебного процесса внедрены  7 автоматизированных информационных систем. Их использование позволяет повысить эффективность управления в различных областях деятельности вуза, а также способствует эффективной и оптимальной организации учебного процесса. Системы позволяют проводить тестирование,  вебинары посредством аудио-видео связи и многое другое.

Казахский медицинский университет непрерывного образования готовит целеустремленных и конкурентоспособных специалистов в отрасли практической медицины, науки и образования и создает все условия для получения качественного образования и научно- исследовательского развития.